Computational Biochemistry

Worum geht's

In diesem Seminar lernst Du computergestützte Methoden für massenspektrometriebasierte Omics kennen. Du beschäftigst Dich mit aktuellen Anwendungen wie Wirkstoffentdeckung und -repositionierung sowie mit praktischen Problemen (Nomenklatur, Identifier-Mapping, Netzwerk-Enrichment, Data Mining) und erwirbst Grundkenntnisse in Programmierung (Einführung in Python) zur Umsetzung kleiner Analyseaufgaben.

Was du danach kannst

• Verständnis verschiedener Ansätze zur Verbindung von Biochemie und Informatik
• Anwenden und Entwickeln einfacher computationaler Tools für Forschungsdaten
• Schreiben von Skripten zum Abfragen online verfügbarer Repositorien
• Netzwerkabbildung und grundlegende Datenanalyse
• Einblicke in state-of-the-art Anwendungen (z. B. Drug discovery / repurposing)

Aus was das Modul besteht

• SeminarPräsentationen einzelner Teilnehmer zu wissenschaftlichen Artikeln in einer Mini-Konferenz
• TutorialEinführung in benötigte Methoden und in Python
• Praktische GruppenarbeitKleine Programmieraufgaben und Entwicklung einfacher Softwarelösungen in Gruppen (3–4 Personen)

Lehrmethode

• EinzelpräsentationenVertiefung und Vermittlung von Verständnis zu ausgewählten Forschungsartikeln
• TutorialsEinführung in computational Methoden und Programmiersprachen (insbesondere Python)
• Praktische Arbeit in KleingruppenAnwendung und Entwicklung einfacher Programme; Förderung multidisziplinärer Kommunikation
• Selbststudium von FachartikelnErarbeitung des Forschungsstands und Vorbereitung der Präsentationen