Modellierung und Simulation biologischer Makromoleküle

Worum geht's

Du lernst computationalen Methoden zur Modellierung und Simulation von biologischen Makromolekülen kennen. Am Ende kannst du die physikalischen Grundlagen von Protein‑Interaktionen erklären, geeignete Modelltypen und Algorithmen auswählen und sie für Aufgaben wie Proteinstrukturvorhersage, Protein‑Design und Protein‑Ligand‑Interaktionen anwenden.

Was du danach kannst

• Kenntnis der physikalischen Grundlagen von Protein‑Wechselwirkungen mit kleinen Molekülen, Aminosäuren, Proteinen, Membranen und Nukleinsäuren
• Vertrautheit mit computergestützten Werkzeugen zur Proteinmodellierung
• Unterscheidung verschiedener molekularer Modelle und Algorithmen
• Auswahl geeigneter Modelle/Algorithmen für Proteinstrukturvorhersage
• Auswahl geeigneter Modelle/Algorithmen für Protein‑Design
• Auswahl geeigneter Modelle/Algorithmen für Protein‑Ligand‑Interaktionen
• Auswahl geeigneter Modelle/Algorithmen für Protein‑Protein‑Interaktionen
• Auswahl geeigneter Methoden zur Probenahme von Protein‑Konformationen

Aus was das Modul besteht

• VorlesungVermittlung der thematischen Inhalte durch Frontal‑ und interaktive Lehrformate

Lehrmethode

• Präsentation (PowerPoint)informieren und strukturieren der Inhalte
• Tafel/HandzeichnungenVisualisierung und Erklärung von Konzepten
• Fallbeispiele / Einzelarbeit mit WebservernAnwenden und vertiefen des Gelernten durch praktische Übungen
• Interaktive Q&A / FlashlightFeedback, Evaluation und Vertiefung des Verständnisses
• Praktische Nutzung von Lizenzsoftware und Webservern (Schrödinger, AlphaFold, I‑Tasser, ClusPro, HADDOCK)Erwerb praktischer Erfahrung durch eigenständige Simulationen und Analyse