Praktikum Protein- und Wirkstoffmodellierung

Worum geht's

Du lernst zentrale rechnergestützte Methoden der Wirkstoff- und Proteinmodellierung kennen und anzuwenden — von der Repräsentation kleiner Moleküle über Docking und Pharmacophore-Modelle bis zu Proteinstrukturvorhersage und Molekulardynamik. Am Ende kannst du passende Software selbstständig einsetzen, Simulationen durchführen und die Ergebnisse fachgerecht interpretieren.

Was du danach kannst

• Chemischer Raum analysieren
• Pharmacophore-Modelle entwickeln
• Ligand-Protein-Docking mit verschiedener Software durchführen
• Eine Virtual-Screening-Pipeline entwerfen
• Molekulardynamik-Simulationen ausführen
• Grundlegende Analysen von MD-Trajektorien durchführen

Aus was das Modul besteht

• Vorlesungführt in Theorie und Anwendbarkeit der jeweiligen Themen ein
• Tutorialzeigt die Arbeitsschritte zur praktischen Umsetzung
• Praktische Übungendu führst Simulationen und Analysen unter Anleitung durch (learning-by-doing)

Lehrmethode

• Frontalvortragvermittelt die theoretischen Grundlagen
• Tutorials und Schritt-für-Schritt-Anleitungenzeigen die konkreten Arbeitsabläufe zur Durchführung der Übungen
• Individuelle und Team-Übungen (think-pair-share, sandwich method)ermöglichen sowohl Einzelarbeit als auch Vergleich unterschiedlicher Methoden im Team
• Experimentelles Lernen / Learning-by-doing (Kolb)praktische Durchführung und Reflexion fördert Fertigkeiten und konzeptionelles Verständnis
• Abschlussberichtdient der Evaluierung und Reflexion des Gelernten