Crop Genomics

Worum geht's

Im Modul lernst Du Aufbau und Organisation von Pflanzengenomen sowie moderne Sequenzier- und Genotypisierungsverfahren kennen. Du erlernst Annotierung und funktionelle Analyse von Genomen, den Zugriff auf Sequenzdatenbanken sowie Bioinformatik- und statistische Methoden zur Analyse von Genomdaten und Genotyp‑Phänotyp‑Assoziationen in Kulturpflanzen.

Was du danach kannst

• Genome von Kulturpflanzen beurteilen
• Konzepte der Next‑Generation‑Sequenzierung erklären
• Genomannotation und funktionelle Analyse erläutern
• Biologische Sequenzdaten aus Datenbanken abrufen
• DNA‑Sequenzvergleich und Alignment verstehen
• Genomische Datenauswertung und Varianten‑detektion durchführen
• Genexpressionsdaten analyseiren
• Genotyp‑Phänotyp‑Assoziationen analysieren
• Geeignete genomische Methoden für konkrete Fragestellungen bewerten

Aus was das Modul besteht

• VorlesungVermittlung theoretischer Konzepte zu Genomorganisation, Sequenzierung, Annotation und vergleichender Analyse
• Übung / ComputerübungenPraktische Anwendung der Konzepte mit Analyse von Datensätzen und Tutorials
• Seminar (empfohlen)Besuch wöchentlicher Vorträge externer Experten zur Ergänzung der Vorlesungsinhalte

Lehrmethode

• PowerPoint PräsentationenEinführung und Darstellung theoretischer Konzepte
• Computerübungen und TutorialsPraktische Anwendung und Analyse von experimentellen Datensätzen
• Literaturarbeit und Präsentationen durch StudierendeEigenständiges Lösen von Problemen und kritische Bewertung von Methoden
• Vortragsreihe (SFB924 Seminar)Vertiefung durch nationale und internationale Expertenvorträge