Intensivkurs Proteomics

Worum geht's

Du lernst Methoden der massenspektrometrischen Proteinidentifikation: Probenaufarbeitung (SDS-PAGE, In-Gel-Trypsinierung), Messverfahren (MALDI-TOF-TOF, HPLC-gekoppelte ESI-MS/MS) und Auswerteverfahren zur Proteinidentifikation. Am Ende kannst Du Peptidspektren interpretieren und die Informationen zur Identifikation unbekannter Proteine einsetzen.

Was du danach kannst

Interpretation massenspektrometrischer Peptidspektren
Anwendung von Peptide Mass Fingerprinting
Erstellung und Nutzung von Sequence Tags
Durchführung automatischer Datenbank-Suchen und Bewertung von Konfidenzkriterien
Kritische Bewertung von Einzel- und Hochdurchsatz-Analysen
Verständnis der Einsatzfelder in der Forschung

Aus was das Modul besteht

Übung/PraktikumPraktische Durchführung von SDS-PAGE, In-Gel-Digestion und massenspektrometrischer Analyse; Auswertung der Spektren
PC-ArbeitAuswertung der MS-Daten, Datenbanksuchen und Diskussion der Ergebnisse

Lehrmethode

LaborPraktische Vermittlung der experimentellen Methoden
PC-ArbeitAnwendung und Übung der Auswerteverfahren und Datenbank-Suchen

Termine

ÜbungIntensivkurs Proteomics5 Gruppen zur Wahl

ADi.09:00–17:00
EG L 12, IT-Schulungsraum (WZWIT12) (4220.EG.112)
2× · 02.03.–16.03.
- 02.03.
- 16.03.
BDo.09:00–17:00
EG L 12, IT-Schulungsraum (WZWIT12) (4220.EG.112)
2× · 04.03.–18.03.
- 04.03.
- 18.03.
CFr.09:00–17:00
EG L 12, IT-Schulungsraum (WZWIT12) (4220.EG.112)
2× · 05.03.–19.03.
- 05.03.
- 19.03.
DMi.09:00–17:00
EG L 12, IT-Schulungsraum (WZWIT12) (4220.EG.112)
2× · 03.03.–17.03.
- 03.03.
- 17.03.
EMo.09:00–17:00
EG L 12, IT-Schulungsraum (WZWIT12) (4220.EG.112)
2× · 01.03.–15.03.
- 01.03.
- 15.03.

Aus dem laufenden Semester, unverbindlich. Von mehreren Gruppen besucht man eine; der Stundenplan schlägt automatisch die mit den wenigsten Überschneidungen vor.

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