Genomische Limnologie

What it is about

In dem Modul lernst Du, wie Umwelt‑DNA (eDNA) zur Untersuchung der Biodiversität und von Nahrungsnetz‑Strukturen in Seen eingesetzt wird. Du durchläufst die komplette Prozesskette vom Probennehmen über Laboraufbereitung und Amplifikation bis zur Sequenzierung (Oxford Nanopore) und zur bioinformatischen Auswertung und Interpretation der Daten im ökologischen Kontext.

What you will be able to do

• Seenökologische Rahmenbedingungen einordnen
• eDNA‑Metabarcoding‑Prozesskette beherrschen
• Labortechniken zur Aufbereitung und Amplifikation von eDNA anwenden
• Sequenzierung mit Oxford Nanopore-Technologie verstehen und nutzen
• Grundlegende bioinformatische Analysen von Metabarcoding‑Daten durchführen
• Sequenzdaten kritisch bewerten und ökologisch interpretieren
• Biodiversitätsmuster und trophische Rollen in Nahrungsnetzen ableiten
• Ergebnisse wissenschaftlich präsentieren

What the module consists of

• Übung/Praktikumgeblockt an der Limnologischen Forschungsstation Iffeldorf mit Freilandanteil, Labor- und Computerarbeit

Teaching method

• praktische FreilandübungenEinführung in das Seesystem und ggf. praktische Planktonbeprobung
• intensive Laborarbeitpraktische Umsetzung der eDNA‑Metabarcoding‑Prozessschritte
• Computerarbeit / Übungenbioinformatische Auswertung und Interpretation der erzeugten Sequenzdaten