Crop Genomics

What it is about

In the module you will learn about the structure and organization of plant genomes as well as modern sequencing and genotyping methods. You will learn annotation and functional analysis of genomes, access to sequence databases, and bioinformatics and statistical methods for the analysis of genomic data and genotype-phenotype associations in crops.

What you will be able to do

• Assess genomes of crops
• Explain concepts of next-generation sequencing
• Explain genome annotation and functional analysis
• Retrieve biological sequence data from databases
• Understand DNA sequence alignment and comparison
• Perform genomic data analysis and variant detection
• Analyze gene expression data
• Analyze genotype-phenotype associations
• Evaluate suitable genomic methods for concrete questions

What the module consists of

• VorlesungVermittlung theoretischer Konzepte zu Genomorganisation, Sequenzierung, Annotation und vergleichender Analyse
• Übung / ComputerübungenPraktische Anwendung der Konzepte mit Analyse von Datensätzen und Tutorials
• Seminar (empfohlen)Besuch wöchentlicher Vorträge externer Experten zur Ergänzung der Vorlesungsinhalte

Teaching method

• PowerPoint PräsentationenEinführung und Darstellung theoretischer Konzepte
• Computerübungen und TutorialsPraktische Anwendung und Analyse von experimentellen Datensätzen
• Literaturarbeit und Präsentationen durch StudierendeEigenständiges Lösen von Problemen und kritische Bewertung von Methoden
• Vortragsreihe (SFB924 Seminar)Vertiefung durch nationale und internationale Expertenvorträge